Самые лучшие фотографии Нептуна, сделанные с Земли, позволяют различить отдельные облака и яркую дымку над южным полюсом планеты.

Космический аппарат «Вояджер-2», пройдя всего в 5000 км над верхним слоем облаков планеты 25 августа 1989 г., обнаружил много новых деталей, в том числе обширную циклоническую систему в южном полушарии - Большое тёмное пятно. К 1994 г. эта система распалась. Вскоре космический телескоп Хаббл обнаружил новое Большое тёмное пятно, но уже в северном полушарии.

«Вояджер-2» передал на Землю снимки другой, меньшей циклонической системы. В ней различимы яркое ядро из крупных и многочисленные полосы из тонких перистых облаков.